MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Methylophaga sp. JAM1 chromosome

Total Repeats: 7261

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017857	CAT	2	6	243935	243940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_017857	GTCT	2	8	243947	243954	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
503	NC_017857	TCA	2	6	243961	243966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_017857	TTG	2	6	243972	243977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017857	CAA	2	6	244157	244162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_017857	A	6	6	244167	244172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017857	GAG	2	6	244180	244185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017857	CTG	2	6	244915	244920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_017857	AAG	2	6	244951	244956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017857	GAG	2	6	245310	245315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017857	T	6	6	246652	246657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017857	TGA	3	9	247761	247769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017857	CAAT	2	8	253703	253710	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
514	NC_017857	A	6	6	255965	255970	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017857	T	6	6	255989	255994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017857	ATA	2	6	258312	258317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017857	TGT	2	6	258843	258848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017857	TAA	2	6	261089	261094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017857	CAA	2	6	261121	261126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_017857	T	6	6	261165	261170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017857	CTG	2	6	261530	261535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_017857	CT	3	6	269682	269687	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
523	NC_017857	CAT	2	6	269692	269697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_017857	TGC	2	6	274369	274374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_017857	CTT	2	6	274427	274432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_017857	GTT	2	6	274474	274479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017857	ATC	2	6	274511	274516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_017857	AAT	3	9	274566	274574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017857	ATTT	2	8	274603	274610	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017857	CTA	2	6	274611	274616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_017857	AAC	2	6	274619	274624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_017857	AGCG	2	8	274676	274683	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
533	NC_017857	TTA	2	6	274730	274735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017857	ACA	2	6	274759	274764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_017857	GCGGA	2	10	274798	274807	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
536	NC_017857	TACA	2	8	274887	274894	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
537	NC_017857	A	6	6	274924	274929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017857	A	6	6	274954	274959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_017857	ATTG	2	8	275009	275016	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017857	ATAA	2	8	275036	275043	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017857	A	7	7	275049	275055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017857	ATG	2	6	275946	275951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017857	TG	3	6	275999	276004	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017857	CCAG	2	8	278358	278365	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
545	NC_017857	CAA	2	6	278452	278457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_017857	ATG	2	6	278465	278470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017857	ACA	2	6	278524	278529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_017857	ACC	2	6	278554	278559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
549	NC_017857	AGG	2	6	278616	278621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017857	CTC	2	6	278623	278628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_017857	GT	3	6	278645	278650	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017857	CAG	2	6	281278	281283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_017857	ATC	2	6	283211	283216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_017857	TTG	2	6	283315	283320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017857	T	6	6	283351	283356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017857	AAT	2	6	283377	283382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017857	CT	3	6	283416	283421	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
558	NC_017857	T	7	7	283477	283483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017857	GCA	2	6	283492	283497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_017857	CAA	2	6	283567	283572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_017857	ACGC	2	8	283593	283600	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
562	NC_017857	AAT	2	6	283622	283627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017857	CTTT	2	8	283639	283646	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
564	NC_017857	GT	3	6	283668	283673	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017857	TTC	2	6	283706	283711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_017857	TCG	2	6	283747	283752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_017857	TTC	2	6	283773	283778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_017857	A	6	6	283951	283956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017857	AAC	2	6	283994	283999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_017857	AAAC	2	8	284123	284130	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
571	NC_017857	GTT	2	6	284147	284152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_017857	CAA	2	6	284159	284164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_017857	AAC	2	6	284187	284192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_017857	GTTT	2	8	284206	284213	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017857	ACA	2	6	284283	284288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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580	NC_017857	T	8	8	286770	286777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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582	NC_017857	TGT	2	6	286938	286943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_017857	T	6	6	286965	286970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017857	AAC	2	6	286986	286991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_017857	TTG	2	6	287121	287126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_017857	T	6	6	287160	287165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_017857	TCT	2	6	287172	287177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_017857	ATA	2	6	287343	287348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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590	NC_017857	A	7	7	287402	287408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_017857	CGT	2	6	287414	287419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_017857	CTTT	2	8	287895	287902	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
593	NC_017857	GTAT	2	8	287973	287980	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
594	NC_017857	CAT	2	6	288100	288105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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597	NC_017857	AGA	2	6	288172	288177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_017857	TA	3	6	294175	294180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_017857	T	8	8	294509	294516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_017857	T	6	6	294954	294959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_017857	TC	3	6	295989	295994	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
602	NC_017857	TGA	2	6	296024	296029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017857	GA	3	6	296045	296050	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017857	CGG	2	6	296103	296108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_017857	TC	3	6	299524	299529	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
606	NC_017857	TCT	2	6	301483	301488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_017857	A	7	7	301498	301504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_017857	CAT	2	6	303336	303341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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610	NC_017857	ATG	2	6	305559	305564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017857	GATC	2	8	305665	305672	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
612	NC_017857	AAGCA	2	10	305737	305746	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
613	NC_017857	GTT	2	6	305754	305759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_017857	ATA	2	6	307420	307425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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616	NC_017857	ATGCT	2	10	307444	307453	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
617	NC_017857	TTTA	2	8	308214	308221	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_017857	GTA	3	9	308275	308283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_017857	ATG	2	6	308335	308340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_017857	A	6	6	308402	308407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_017857	GC	3	6	308424	308429	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
622	NC_017857	A	8	8	308469	308476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017857	GA	3	6	308511	308516	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
624	NC_017857	AAG	2	6	308559	308564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_017857	TTATT	2	10	308580	308589	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_017857	CAAA	2	8	313100	313107	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
627	NC_017857	AG	3	6	313771	313776	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017857	AAT	2	6	314417	314422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017857	ATT	2	6	314465	314470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_017857	ATT	2	6	315324	315329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_017857	A	8	8	315348	315355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_017857	GCTG	2	8	315377	315384	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
633	NC_017857	TTA	2	6	315454	315459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_017857	AGT	3	9	315477	315485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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636	NC_017857	TAG	2	6	317614	317619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
637	NC_017857	TTA	2	6	319199	319204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_017857	TTTGT	2	10	319217	319226	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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